Unter den drei aus dem Sicherheitstrakt einer Strafanstalt entkommenen Häftlingen befindet sich nach Recherchen des Scorpion-Teams auch das Computergenie Nerd Percy. Walter und seine Kollegen gehen zunächst davon aus, dass die anderen flüchtigen Verbrecher den IT-Spezialisten zum Knacken der Sicherheitscodes gezwungen und ihn dann mitgeschleppt haben. Doch während der Untersuchungen wird langsam deutlich, dass es Percy war, der hinter dem Ausbruch steckt und damit einen bestimmten Plan verfolgt.