Dem 17-jährigen Oberschüler und Detektiv Shinichi Kudo wird von zwei Männern in Schwarz ein Gift verabreicht, dass ihn wieder zu einem kleinen Jungen werden lässt. Daraufhin nennt er sich Conan Edogawa und kommt bei seiner Freundin Ran und deren Vater, dem Privatdetektiv Kogoro Mori, unter. Heimlich löst er dessen Fälle: Conan befürchtet, dass Ai Haibara Professor Agasa getötet hat. Doch als er in dessen Haus eintrifft, findet er die beiden lebend vor. Ai erzählt daraufhin ihre Geschichte...